대학원에 따라 정규과정 이외에 연구생, 청강생, 과목등이수생이 있다.

단기대학 졸업자와 전문학교 졸업자, 대학의 교양과정(1~2학년) 수료자, 그리고 4년제 대학 종럽자가 전고을 바꾸어 학위코스에 들어가기 위해 대학교 2년 차, 3냔 타로 편입하는 것을 인정하는 경우가 있다. 2년 차로의 편입 단위는 30단의, 3년 차로의 편입단위는 62단위가 필요한 경우가 많다.

대학학부의 1학년 신입생으로 입학할 때의 입학시험과 같으며, 필요한 서류제출과 소논문 그외의 필기시험등을 실시한다.

청강생이나 과목 등 이수생의 수강자격이나 청강을 허가하는 과목(학점)수 등은 학교마다 다르나, 비정규생인 청강생, 과목 등 이수생으로 재류자격(유학)을 받기 위해서는 둘 다 법률(출입국 관리 및 난민 인정법)에 정해진 것과 같이「주10시간(600분의 청강)」이 필요하다.

대학원(연구생 포함)에 입학하기 위해서는 먼저 자신의 전공과 연구주제를 정하여 원서 제출전에 입학을 희망하는 대학원의 지도교수님에게 서전 승인을 받을 필요가 있다. 자신의 출신 대학 담당교수로부터 지도교스를 소개받거나, 그럿이 어려울 경우는 각 대학의 요람, 학회지, 선배 유학생, 대학에 문의를 하는 등 정보를 입수해 자신의 전공내용과 맞는 지도교수를 찾아야 한다, 지도교수를 찾으면 이메일이나 편지등으로 연락을 취해 가능하다면 직접 교수와의 면담을 신청하고, 편지 등 서면일 경우에는 지금까지의 연구결과, 앞으로의 연구계획서, 지원이유 등을 구체적으로 명기해 사전 승인을 받도록 하자.

한국에서 대학을 졸업한 후 일본의 대학원에 입학할 경우, 연구생 과정을 필요로 하는 경우가 있다. 약 반 년에서 1년 정도의 기간 동안 석사과정을 밟기 위한 준비과정으로 학위취득은 인정되지 않는다. 또한 대학원 정규과정으로 입학을 희망할 경우 입학 시험을 거쳐야 하는 경우가 대부분이다.

모집요강은 대부분 입학 전년도 6~8월에 발표되며 각 대학원에 따라 원서마감일, 출원 방법, 출원기간, 출원서류 등에 차이가 있으므로 주의해야 한다.

연구생 / 대학원 입학원서(지정양식), 이력서(지정양식), 연구계획서,
최종 출신 학교 등의 졸업(수료)증명서 또는 학위 증명서, 성적증명서, 교수님의 추천서(지정양식), 건강진단서(지정양식), 외국인등록증명서(외국인등록을 하지 않은 경우는 여권의 복사본), 일본어능력시험, 유학생시험 통지서